市场经济条件下，品牌意味着信用、客户和利润。从目前种子市场经营主体看，大多数企业的所谓品牌经营，不过是在工商部门申请商标注册，而经营的品种、手段都差不太多，几乎是千篇一律，根本谈不上品牌经营。真正的品牌经营，根基在于企业创新，包括以下三个方面：

科技创新

市场竞争的核心是科技的竞争，种子知名品牌与非知名品牌的差别短期看是种子质量价格、广告、营销手段等原因造成的，但从长期看，依靠的还是科技。科技含量高，能够集优质、高产、多抗为一体的农作物新品种，在开拓市场时就能够形成品牌效应。如东亚种业、丹东种业等一些省内知名企业培育的东单60等新品种，很快成为大部分地区的玉米主栽品种，形成知名品牌，就是靠科技创新进行品牌经营的成功典范。

种子行业科技创新，首先要充分挖掘自身的内部资源和科研成果，自行选育优新品种。世界上一些大公司和种业集团每年科研开发投入占销售收入一定的比例，选育出大批农作物新品种。其次要在自己研发基础之上，与大的企业和科研院校开展广泛的联合，实现自己的科技创新，这种运作方式在我国一些大的企业中得到普遍应用。

管理创新

企业管理内容广泛，含义深刻，涉及面很宽。种子企业要在管理上创新，最重要的一条是质量管理创新。种子质量出问题，再知名的品牌也会被淘汰，更谈不上品牌经营了。随着《种子法》的实施，国家对种子质量要求越来越高，农民的法律意识越来越强，种子质量已成为企业生存的基础和形成知名品牌的关键所在，因此在管理上，我们要加大创新力度，推行和贯彻种子质量认证体系及质量标准，为品牌经营打下良好的基础。

体制创新

计划经济体制下，国有种子公司一统天下，受“大锅饭”、“平均主义”的影响，企业只顾眼前利益，不求长远发展。随着市场经济的发展，国有企业人员多、债务重的弊端日益严重，举步维艰。此时，体制创新显示了巨大的动力，许多国有种子公司进行了资产重组兼并、股份制改造、民营改造等一系列创新，企业重新焕发了生机，先后有丰乐种业、亚华种业、隆平高科等种业集团成功进入证券市场，形成国内知名品牌。