秋季是花卉种子成熟的时节，采收种子要掌握好种子的成熟期和成熟度。种子的成熟有早有晚，即使是同一株花木，也不可能同时成熟，要随熟随采，以免种子霉烂或熟透散落。在采收种子时，要选开花早或成熟早的种子留种。这样的种子来年播种后发芽早，且幼苗健壮，以后开花也早。如发现花型或颜色有变异的植株应单独采收，单独种植，这样有可能会繁育出新品种。

采收花卉种子的方法因花卉种类不同各有差异。有的可将整个花朵摘下，风干后取种，如鸡冠花、一串红等。浆果类的采摘后应放在水中，用手揉搓洗去果肉，清洗出种子后晾干，如金银茄、珊瑚豆等。有些花卉，在果实成熟后，果皮开裂，种子也弹射出去，如紫薇、凤仙花等。因此应选果实由绿转黄褐色时，及时采收，以免种子散失。还有些球根花卉，如大丽花、美人蕉、花叶芋等，在北方下霜前应及时把球根挖起，以免受冻害。球根挖出晾晒后，放于室内进行沙藏。