新疆赛里木现代农业股份有限公司由新疆艾比湖农工商联合企业总公司作为主发起人，于1999年12月22日设立。现注册资本18000万元人民币。2004年1月7日，公司在上海证券交易所挂牌上市。

公司先后被兵团科委和新疆科技厅分别审定为"高新技术企业"，被自治区工商局和国家工商行政管理总局分别认定为"守合同重信用企业"，被国家农业部、计委、经贸委、税务总局等九部委审定为"农业产业化国家重点龙头企业"。经过多年不懈努力，公司已发展成为以农业高新技术产品研究与开发，以棉业、种业、油脂、木业的产业化经营为主营业务，集科、农、工、贸于一体的高新技术企业。目前公司拥有三个农业分公司，一个农业科学研究所，三家控股子公司。

公司总体发展战略思路是：做优做强棉业，壮大提升种业，拓展特色产业，发展农副产品深加工，通过募集资金投资项目的实施，架构起公司主业框架，基本建立起以棉业、油脂、种业、木业四大产业为主营业务的产业架构；形成年产优质细绒棉3万吨、精炼食用油20万吨、优质粮棉种子1.5万吨、进口和加工原木10万立方米的生产规模。

目前公司已开始全面实施油脂产业和木业产业的扩张整合战略、技术创新战略和品牌创建战略。2004年，公司投资1500万元控股了新赛钢木制品有限责任公司；投资7400万元与农五师国资委共同设立了博乐新赛油脂有限公司，整体收购了原新疆赛里木油脂总厂的净资产，以其品牌优势、技术优势、人产优势和管理优势实施油脂产业的扩张与整合。2005年，投资2700万元与农三师国资经营公司共同设立了图木舒克新赛油脂有限公司。