吉林省农业科学院是一所以应用研究和应用基础研究为主的省级农业科研机构，历史悠久，其前身最初是建于1913年的南满铁道株式会社公主岭农事试验场，1948年东北解放，建立了东北行政委员会农业部农事试验场，1953年改为东北农业科学研究所，1958年改为中国农科院东北农业科学研究所，1959年在此基础上建立吉林省农业科学院至今。多年来，在省委省政府的关怀和领导下，经过几代科技工作者的不懈努力，吉林省农科院已经发展成为了一所专业学科齐全，科技人才荟萃，科研成果丰硕，科技产业快速发展，科技创新能力不断增强的现代农业科研机构。

省农科院现有直属研究机构11个：大豆研究中心、农业生物技术研究中心、农业环境与资源研究中心、农业经济与信息服务中心、农产品加工研究中心、畜牧科学分院、植物保护研究所、玉米研究所、水稻研究所、作物育种研究所、果树研究所。全院总占地面积545公顷，其中试验用地400公顷；总建筑面积29多万平方米，拥有大型仪器设备1500多台件，科技文献收藏量30余万册，有各种珍贵档案资料40000卷。

院主管的教学、科研单位4个：吉林农业工程职业技术学院、吉林省甜菜糖业研究所、吉林省洮南甜菜育种研究所、四平粮食学校（省政府已经决定划归我院管理，即将进行接收）。

"九五"以来，省农科院承担了国家一大批重点科研机构建设。设在吉林农科院的国家和省科研机构有：国家玉米工程技术研究中心（吉林）、国家大豆工程技术研究分中心，国家玉米、大豆、水稻改良分中心，农业部农作物新品种检测分中心、国家黑土肥力和肥料效益监测基地、国家北方寒地果树资源圃、农业部北方粳稻原原种繁殖基地、农业部牛胚胎移植中心、国家赤眼蜂工厂化生产基地、农业部大豆遗传育种开放实验室，国家转基因农产品安全评价中心、国家转基因农产品检测中心、农业部农作物新品种保护中心、国家玉米种子产业化基地、东北黑猪生产基地、国家牧草种子生产基地、吉林省农业生物技术重点开放实验室、正在与德国合作建设了转基因农产品安全检测实验室（检测的转基因农产品在欧洲市场上得到认可）、吉林省农业昆虫重点开放实验室等重点科研机构，并且正在争取国家杂交大豆改良中心和建立博士后科研工作站。

在吉林省委省政府的领导下，在省科技厅、财政厅、农委、计委等部门的大力支持下，1999年吉林省农科院争取到了国家转基因植物研究与产业化专项--"转基因植物中试及产业化基地（吉林）"建设项目。五年来，国家和省对该基地的投入资金已达1.4亿元。国家转基因植物中试与产业化基地的建设，为吉林省科技创新能力的提高发挥了重要的作用。