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目前全院有水稻、旱作物、植保、土肥、园艺、畜牧兽医、农业经济、科技情报、蔬菜花卉、农副产品加工测试、农业应用微生物、农业工程、原子能应用等13个专业研究所。建有江西省农业科学院生物工程中心、江西省杂交水稻技术工程中心、红壤区域开发治理研究中心、江西省农业科学院食品加工中心、农业部肉及肉制品质量监督检验测试中心、江西省水稻生理及遗传重点实验室、江西省东乡野生稻发展研究中心、绿色食品产品质量监测中心（南昌）、江西省农科院绿色食品环境检测中心、江西省农业工程咨询中心、江西省农机产品质量监督检验二站、农业部江西食用菌菌种场、江西省无公害农产品定点检测机构、江西省现代作物遗传育种重点实验室、江西科苑辐照技术开发有限公司。编辑出版了《江西农业学报》、《江西农业科技》、《江西省农科院科技动态》、《科技发展前沿》等科技期刊与杂志。全院现有在职职工594人，其中各类专业技术职称人员380人，副高以上职称人员114人，博士12人，享受国务院、省政府津贴专家 41 人。全院占地面积1631亩，有各类试验示范基地近796亩。每年承担国家、省部级及有关部门的科研课题110项，取得了丰硕的科研成果。九五"以来获省以上科技成果奖57项，累计推广科技成果5000多万亩，新增社会经济效益20多亿元。为江西农业的发展作出了应有的贡献。