云南省农业科学院1976 年成立。是云南省政府直接领导的多学科、综合性农业科研机构。下属十五个科研所，分布在云南的七个地、州、市。现有在职职工 1600多人。全院专业技术人员 960 人，其中高级专业技术人员 200 人，在职和在读博士 20 人，在职在读硕士 160多人。全国劳模3人，省劳模12人，“国突”专家3人，“省突”专家17人，云南省中青年学术学科带头人（后备人才）和省技术创新人才16人，29人享受政府特殊津贴。

全院土地面积 12000 余亩；各类建筑 73.5 万平方米；固定资产 1.4亿元。
云南省农业科学院承担着云南省全局性、关键性、战略性重大农业科技问题的研究任务。建院二十多年来，在省委、省政府领导下，为云南农业和农村经济的发展,尤其是为我省主要农产品从长期短缺到基本平衡，丰年有余的历史性转变；为农业生物资源开发支柱产业（烟、糖、茶、花）的形成做出了重要贡献。水稻专家蒋志农荣获云南省首次科技突出贡献奖。

“十五”以来，每年承担国家和省的各类科研项目 120 多项。获省级以上科技成果奖 49项，其中：“云南稻种资源核心种质库的构建” 获省自然科学类一等奖 、“栽培稻种间杂种优势及其育性遗传研究”等2个项目获省自然科学类二等奖；“粳稻新品种合系41号选育”、“优质菜用蚕豆品种云豆324选育”获省科技进步一等奖，“金沙江干热河谷典型区土地退化与治理途径研究”等9个项目获省科技进步二等奖；“五彩甜玉米的选育”获省技术发明二等奖。育成并通过省级品种审定的农作物新品种 49个。发表论文1000余篇，其中1篇在美国科学院院报上发表。累积组织实施科技成果示范推广项目200多项，累积面积4000多万亩，为全省农业生产发展提供了科技支撑。

经过建院二十多年的发展建设，农科院学科发展涵盖了主要农业产业和农业科研领域。农作物新品种选育、品种资源的收集保存与研究、农业生物技术、分析测试、优质粮经作物种子、种苗生产繁育技术、农业工程咨询设计等更加具有优势和特色，生物资源开发、农业环境保护等适应农业发展需求的科研取得较大的进展。选育的粳稻品种占种植面积的70%以上；花培“双低”油菜品种占全省油菜种植面积的80%以上，并推广到内蒙、青海、广西等省区；生产的花卉种苗占昆明花卉种苗销售市场的35%；选育生产的优质蚕种占全省蚕种市场的40%。农业工程的咨询设计,已完成我省及广西等省区70多项省部级农业项目的设计。农产品质量检测中心，成为全省农产品监测的重点部门，取得了“国家无公害农产品定点检测中心”、“中国绿色食品定点监测中心”的资质。与30多个国家和国际组织的40多个单位开展了实质性的合作与交流，取得了红皮梨等合作研究成果。与云南大学共建国家生命科学技术创新人才培养基地、分子生物学与生物化学硕士学位点。与云南农业大学全面开展科教合作，合办的云南农业大学农业技术学院已正式招生，一批科技人员受聘为云南农业大学硕士生导师和客座教授，科研所作为学校的实习基地。

目前，我院科研机构和专业技术人员分别占省级农业科研机构和专业技术人员总数的 65% 和 63% ，成为我省设备先进、学术水平较高、科研开发综合能力较强，对云南省农业发展有重要影响的农业科研机构，是云南农业和农村经济发展中的科技骨干力量。